Państwa członkowskie od dnia 1 stycznia 2013 r. muszą stosować przepisy pozwalające na przesyłanie e-faktur w dowolnej formie. Tak wynika z Dyrektywy Rady 2010/45/UE z dnia 13 lipca 2010 r. zmieniającej dyrektywę 2006/112/WE w sprawie wspólnego systemu podatku od wartości dodanej w odniesieniu do przepisów dotyczących fakturowania.

W Dzienniku Urzędowym Unii Euro­pejskiej L 189/1 zostały opublikowane zmiany do Dyrektywy 2006/112/WE liberalizujące przepisy dotyczące e-faktur. Z przepisów tych wynika, że faktury papierowe i elektroniczne powinny być traktowane jednakowo. Muszą jednocześ­nie odzwierciedlać faktyczne transakcje.

Dyrektywa w dalszym ciągu stwierdza, że musi być zachowana autentyczność pochodzenia i integralność treści faktur. Przy czym autentyczność pochodzenia oznacza pewność co do tożsamości dostawcy lub usługodawcy albo wystawcy faktury, natomiast integralność treści oznacza, że w fakturze nie zmieniono danych. Nowością jest jednak to, że zarówno autentyczność, jak i integralność można zapewnić za pomocą dowolnych kontroli biznesowych. Natomiast zaawansowany e-podpis oraz elektroniczna wymiana danych (EDI) są tylko jednymi ze sposobów potwierdzenia. Ponieważ istnieją również inne technologie, nie należy zatem wymagać od podatników stosowania żadnej szczególnej technologii fakturowania elektronicznego. To oznacza, że Dyrektywa pozwala na przesyłanie faktur np. e-mailem. Dyrektywa wchodzi w życie z dniem 11 sierpnia 2010 r.

Państwa członkowskie wymienioną Dyrektywę muszą stosować dopiero od 1 stycznia 2013 r. Nie oznacza to jednak, że przepisów w tej kwestii nie można wprowadzić wcześniej. W przypadku Polski jest to bardzo możliwe. Jak bowiem wynika z odpowiedzi na interpelację poselską nr 16721, w Ministerstwie Finansów podjęto już prace oceniające możliwość ewentualnej zmiany rozporządzenia Ministra Finansów w sprawie wystawiania oraz przesyłania faktur w formie elektronicznej…, w kierunku uwzględniającym zmieniające się otoczenie prawne i technologiczne. Jednak decyzja co do kształtu przyszłych rozwiązań w podatku VAT w tym zakresie zostanie podjęta dopiero po zakończeniu tych prac.