W przypadku gdy podatnik złożył deklarację VAT z błędami, to prawo do zwrotu podatku powstaje w dacie wydania decyzji przez urząd skarbowy, a nie w dacie złożenia deklaracji przez podatnika. Tak wynika z wyroku NSA z dnia 5 sierpnia 2011 r., sygn. akt II FSK 373/10.

Naczelnik urzędu skarbowego dokonał zaliczenia zwrotu nadpłaty należnej spółce za grudzień 2006 r. na poczet zaległości podatkowej z tytułu VAT. Przy czym zaliczenia tego dokonał z dniem wydania decyzji określającej podatek. Organ wskazał, że spółka w każdej ze składanych za grudzień 2006 r. deklaracji VAT-7 (pierwotnej i korygujących) ujmowała inne wartości, wykazując przy tym najpierw kwotę podatku do przeniesienia na następny okres rozliczeniowy, kolejno podatek do zwrotu, a ostatecznie kwotę podatku należnego podlegającą wpłacie. Ponieważ z przeprowadzonej kontroli podatkowej wynikało, iż żadne z tych rozliczeń nie jest prawidłowe, organ pierwszej instancji uznał, że możliwość dokonania zwrotu podatku powstała w dniu wydania decyzji.

Spółka nie zgadzając się ze stanowiskiem organu złożyła skargę do WSA, który nie uznał jej za zasadną. W tej sytuacji wniosła ona skargę kasacyjną. W jej ocenie bowiem WSA nieprawidłowo przyjął, że prawo do zwrotu podatku powstało dopiero w dniu wydania decyzji przez organ podatkowy.

Naczelny Sąd Administracyjny uznał, że skarga kasacyjna nie ma uzasadnionych podstaw. Według NSA stanowisko Sądu pierwszej instancji przedstawione w uzasadnieniu wyroku jest trafne. Nie można mieć wątpliwości, że podatnik ma prawo do samodzielnego określenia wysokości podatku do zwrotu, gdyż chodzi o samoobliczenie zobowiązania podatkowego powstającego z mocy prawa. Sąd zasadnie wskazał, iż prawo do zwrotu powstaje w dniu złożenia deklaracji podatkowej lub jej korekty, pod warunkiem jednak, że podatnik prawidłowo dokonał samoobliczenia podatku, w tym podatku do zwrotu. Z kolei jak wynika z art. 21 § 3 Ordynacji podatkowej, organ podatkowy dokonuje prawidłowego określenia wysokości zwrotu podatku w sytuacji, gdy stwierdzi, że kwota zwrotu podatku jest inna niż wykazana w deklaracji (czy korekcie). To zaś oznacza, że prawo do zwrotu podatku powstaje w dacie określenia wysokości podatku do zwrotu w decyzji, a nie w dacie deklaracji (czy korekcie) złożonej przez podatnika.

Sąd zaznaczył, że w rozpatrywanej sprawie żadna z korekt deklaracji VAT-7 za grudzień 2006 r. nie zawierała prawidłowego rozliczenia podatku od towarów i usług za ten okres.