Dostawa sprzętu medycznego i wykonanie prac przystosowujących pomieszczenia, w których sprzęt ten będzie pracował (w postaci wykonania instalacji elektrycznej, klimatyzacyjnej oraz izolacyjnej), stanowią dwa oddzielne świadczenia i w taki sposób powinny zostać opodatkowane. Tak uznał NSA w wyroku z dnia 1 czerwca 2011 r., sygn. akt I FSK 869/10 (orzeczenie prawomocne).

Sprawa dotyczyła spółki, która wystąpiła o wydanie interpretacji indywidualnej wskazując, że prowadzi działalność gospodarczą w zakresie sprzedaży wyrobów medycznych w rozumieniu ustawy o wyrobach medycznych. Ze względu na wysokie zaawansowanie technologiczne sprzedawanego sprzętu oraz wymogi bezpiecznego i prawidłowego jego funkcjonowania wskazała, że niezbędna jest również instalacja (montaż) oraz konieczność dostosowania pomieszczeń użytkownika tego sprzętu, zgodnie z wymogami producenta oraz przepisami regulującymi bezpieczeństwo użytkowników i pacjentów. Spółka zamierza oferować dostawę i montaż tego sprzętu razem z wykonaniem instalacji elektrycznej do podłączenia urządzenia, wykonaniem instalacji klimatyzującej pomieszczenie, w którym sprzęt będzie używany zgodnie z wymogami producenta. Zdaniem spółki sprzedaż dodatkowego wyposażenia wyrobu medycznego, bo tak zakwalifikowała wykonywane instalacje niezbędne do działania urządzenia, może być opodatkowana preferencyjną (w ówczesnym stanie prawnym - 7%) stawką VAT. W interpretacji indywidualnej Minister Finansów uznał to stanowisko za nieprawidłowe. Wskazał bowiem, że dostawa wyrobu medycznego mogła zostać opodatkowana przy zastosowaniu 7% stawki VAT, natomiast wykonywane usługi wyposażenia dodatkowego pracowni stanowiły usługi budowlane opodatkowane podstawową stawką VAT.

Sprawa ostatecznie po skardze kasacyjnej organu podatkowego trafiła do NSA. Jak wskazał Sąd, istotą sporu jest kwalifikacja świadczeń - w zakresie dostawy urządzenia medycznego oraz w zakresie wykonania prac budowlanych - jako jednego świadczenia złożonego. Jak podkreślił Sąd, zgodnie z art. 41 ust. 1 i 2 w związku z załącznikiem nr 3 do ustawy o VAT, 7% stawką VAT opodatkowana jest dostawa towarów w postaci wyrobów medycznych w rozumieniu ustawy o wyrobach medycznych. Jednak czy stawką tą można - w ramach opodatkowania świadczenia złożonego - objąć wykonanie prac budowlanych? W ocenie Sądu niesporna pozostaje okoliczność, że wskazane przez spółkę dodatkowe usługi, które musi wykonać, by spełnione były warunki stawiane przez producenta dla prawidłowego funkcjonowania urządzenia medycznego, kwalifikowane są według PKWiU do usług budowlanych, opodatkowanych stawką podstawową. Jednakże z uwagi na to, że nie ma definicji świadczenia złożonego w polskiej ustawie o VAT ani dyrektywach unijnych, konieczne jest każdorazowe przeanalizowanie charakteru szeregu powiązanych ze sobą czynności. Argumentacją przemawiającą za tym, aby dostawę sprzętu medycznego oraz prac budowlanych polegających na przystosowaniu pomieszczenia, w którym ma być on montowany opodatkować odrębnie, jest brak wykazania przez dostawcę sprzętu, że przedmiotowa dostawa i świadczone usługi są tak wzajemnie powiązane, że ich rozdzielenie miałoby charakter sztuczny prowadzący do pogorszenia funkcjonalności systemu VAT.