Jeżeli podatnikowi przy nabyciu towaru (nieruchomości) przysługiwało prawo do odliczenia VAT, a późniejsza jego sprzedaż podlegać będzie zwolnieniu z VAT, spowoduje to wystąpienie obowiązku dokonania korekty podatku naliczonego. Tak uznał WSA w Warszawie w wyroku z dnia 2 czerwca 2010 r., sygn. akt III SA/Wa 2080/09.

We wniosku o interpretację podatnik wskazał, że w maju 2004 r. nabył prawo użytkowania nieruchomości gruntowej oraz znajdujący się na tej nieruchomości, stanowiący odrębną nieruchomość, budynek administracyjno-handlowy. Podatek VAT przy nabyciu został odliczony. Z uwagi na to, iż część znajdujących się w budynku pomieszczeń była wynajmowana, podatnik po nabyciu przedmiotowego budynku do października 2004 r. wystawiał faktury na najemców. Od tego czasu aż do dnia złożenia wniosku przedmiotowy budynek nie był wykorzystywany do działalności gospodarczej. Ponadto w momencie nabycia przedmiotowy budynek został zaklasyfikowany jako środek trwały w budowie, natomiast w 2008 r. został bilansowo zaklasyfikowany jako aktywa przeznaczone na sprzedaż. W związku z tym zadano pytanie, czy w przypadku kiedy sprzedaż tego budynku korzystać będzie ze zwolnienia z VAT, to podatnik będzie zobowiązany do dokonania korekty VAT.

Organ podatkowy stwierdził, że odliczając podatek podatnik uznał, iż budynek służyć będzie czynnościom opodatkowanym. Z uwagi na to, iż sprzedaż nieruchomości podlegać będzie zwolnieniu z VAT, nastąpi zmiana przeznaczenia tej nieruchomości. W konsekwencji na podstawie art. 91 ust. 7d ustawy o VAT podatnik będzie zobowiązany do dokonania korekty VAT, w deklaracji podatkowej za miesiąc, w którym powstanie ta zmiana.

Podatnik złożył skargę do WSA, który ją oddalił. Zdaniem Sądu w omawianej sprawie nie ulega wątpliwości, że nastąpi zmiana przeznaczenia nieruchomości, bowiem jej sprzedaż będzie zwolniona z podatku. Dlatego też podatnik będzie zobowiązany do dokonania korekty. O tym czy dany towar stanowić będzie środek trwały, czy też będzie towarem handlowym decyduje sam podatnik. Podatnik wskazał, że w 2008 r. budynek został zaklasyfikowany bilansowo jako aktywo przeznaczone do sprzedaży. Zatem od czasu podjęcia decyzji o zakwalifikowaniu przedmiotowego budynku jako aktywa do sprzedaży budynek ten nie był wykorzystywany do czynności podlegających opodatkowaniu podatkiem VAT.