Ministerstwo Finansów nie zamierza darować pracodawcom ani pracownikom podatku od pakietów medycznych za okres sprzed uchwały NSA z dnia 24 maja 2010 r. (sygn. akt II FPS 1/10) nakazującej ich opodatkowanie. Według resortu płatnicy, którzy mając wątpliwości w kwestii opodatkowania abonamentów medycznych, nie wystąpili o interpretację indywidualną i zdecydowali się nie pobierać zaliczek od tych świadczeń, ponieśli ryzyko, którego wielkość musieli oszacować.

Jak wskazuje Ministerstwo Finansów w odpowiedzi na interpelację poselską nr 16702, w świetle powołanej uchwały NSA ryzyko to się nie opłaciło. Dlatego też zdaniem Ministerstwa zarówno płatnicy, jak i podatnicy będą musieli ponieść z tego tytułu przewidziane prawem konsekwencje.

Resort finansów we wskazanej odpowiedzi zaznaczył, że z przepisów podatkowych jednoznacznie wynika, iż pracodawca musi doliczać do przychodów pracownika wartość faktycznie otrzymanych przez pracownika m.in. nieodpłatnych świadczeń (np. usług medycznych) i odprowadzać od nich zaliczki na podatek dochodowy. Płatnikowi, który nie pobrał i nie wpłacił zaliczki od świadczenia z tytułu abonamentu medycznego, przysługuje prawo do skorygowania deklaracji PIT-4R i odprowadzenia zaległego podatku dochodowego wraz z odsetkami za zwłokę oraz skorygowania informacji PIT-11. Ministerstwo ostrzegło, że w przypadku nieskorzystania z tego uprawnienia organy podatkowe będą wszczynały wobec takich płatników postępowania podatkowe i wydawały decyzje o odpowiedzialności podatkowej płatnika.

Jednocześnie Ministerstwo Finansów podkreśliło, że nie zwalnia to pracowników, którym pracodawcy sfinansowali pakiety medyczne, z obowiązku wykazania ich wartości w zeznaniu podatkowym jako dochodów podlegających opodatkowaniu. Zaznaczyło przy tym, że w odniesieniu do usług zakupionych przez pracodawcę, jakimi są pakiety medyczne, wartość pieniężną tych świadczeń dla celów podatkowych ustala się według cen zakupu. W przypadku ich niewykazania pracownik ma możliwość skorygowania zeznań podatkowych za lata, w których nie wykazał dochodu z tytułu abonamentu medycznego.

Według resortu finansów stanowisko NSA potwierdza jego dotychczasową opinię w omawianej kwestii oraz ostatecznie rozwiewa wątpliwości co do tego, czy było ono poprawne.